第二关的比试很快开始，国教学院以总分第二的成绩进入到这一轮。在这一关中，他们需要以六人为一组且在两个时辰内走出煮时林迷宫，而且在迷宫中插有两面标旗，率先拔出标旗的两人，则直接进入决赛。
煮时林迷宫看似简单，实则内里却是出了名的凶险，更别提天海牙儿等人，就等着陈长生落单，便诛杀于他。果然，当陈长生等人进入煮时林后，发现这里居然是一个镜像的世界，并且还有遁卫守侯于此，确是万分之凶险。
好在落落发现角落处的锦盒，原来里面放着的就是走出迷宫的线索，陈长生通过锦盒中的算筹，很快计算出遁卫出现的规律并引导落落他们避开遁卫，逃进生门。与此同时，七杀假扮的学院弟子，也开始大肆屠戮，然而危险远不止如此，莫雨发现陈长生居然能避开遁卫后，居然命令侍卫想方设法将落落与陈长生分开，然后再对陈长生下毒手。
在侍卫的刻意引导之下，唐三十六和轩辕破与陈长生和落落走散，紧接着陈长生和落落又出现在另一处地方。只是令他们没有想到的是，面前居然躺着四名天道院弟子的尸体，陈长生看着那熟悉的手法，意识到应该是有魔族之人混了进来，趁机杀害各大学院弟子。这时，庄换羽带着另外一批人赶到，看到地上的尸体，庄换羽一口咬定是陈长生所杀，只是不等陈长生开口解释，不知从何而来一枚暗器居然打伤落落，不得已陈长生只得带落落先行离去。
落落看着陈长生温柔的为自己包扎腿上的伤口，心中是说不出的幸福与感动，然而她也知道，如果此时她继续跟陈长生一起行动，怕是会拖累于他，于是便提出让陈长生独自离开迷宫。好在陈长生并未同意落落的要求，否则等着二人的只怕是更加危险的处境。
就在落落休息的工夫，陈长生仔细回顾从进入煮时林迷宫开始的所遇所见，先是石迷宫再是草迷宫，他突然意识到每一个迷宫的算筹都是不同的材质，这是否代表了离开迷宫的线索?通过反复的演算，陈长生果然找到这些算筹的规律，成功找到走出迷宫的线索。
就在陈长生背着落落来到终点之时，苟寒食等人也恰好刚刚到来，眼看标旗近在眼前，莫雨却是万分焦急，她再顾不得落落的安危，强行命令遁卫向着陈长生而去，务必阻止他拿到标旗，她这样的举动，毫无意外引起教宗的注意，陈长生是商行舟的徒弟，而教宗恰恰是商行舟的师弟，莫雨这样的做法，令得教宗无法继续保持沉默。
陈长生一面要照顾背上的落落，一边还要躲闪来势汹汹的遁卫，但是尽管如此，他也没有半分迟疑，朋友知己亦或逆天改命，对他而言都是不可或缺的，哪怕前路艰险重重亦不能阻止他前进的脚步。反观苟寒食这边，却是借着这个机会，轻松拿到标旗，然而还不等他享受胜利的喜悦，魔族七杀突然出现，出手攻击离山剑宗的弟子。苟寒食大惊失色，就在他想出手加入战斗的时候，蓦然发现自己被困于阵法之中，此时的七间更是腹背受敌，危在旦夕。关键时刻，幸亏陈长生和落落出手救下七间。
魔族七杀看行动无法成功也不再恋战，迅速离开了煮时林迷宫。这个时候，天海牙儿也来到终点，看着面前的最后一面标旗，陈长生对此是志在必得。回想过去种种，自从师父告诉他命不久矣，到如今这一路走来，他吃过那么多苦，才终于来到最后一关，如何能在此时前功尽弃?然而陈长生却不知道，就在他参加大朝试的工夫，计道人却带着余人离开了他们共同生活十几年的地方。
陈长生拼着全部的力气向着标旗而去，天海牙儿亦是同样。突然脚下的一个踉跄，陈长生带着落落摔倒在地，落落马上出手却与天海牙儿同时抢到标旗，好在徐有容从天而降，故意踩断天海牙儿手中握着的旗竿，使落落最终拿走标旗。她这样的举动，看似无心之失，但落在同样赶来的秋山君眼中，却是别样滋味。
天海牙儿一口咬定标旗是被徐有容所毁，教宗为公平起见，建议陈长生与天海牙儿再加试一局，不想天海牙儿却趁机提出蒙眼对战听声辩位，他利用自己天生神耳的优势，自然不会将陈长生放在眼中。只是未曾想陈长生并不是传闻中那般不堪一击，哪怕没有天生神耳，他也一样能通过声音准备判断出天海牙儿的位置，并将其打下擂台。恼羞成怒的天海牙儿，本想暗算陈长生，不想却被当初落落送他的那块玉佩，替他挡下天海牙儿的攻击。
最后一场比试，陈长生和苟寒食要在教宗营造的青叶世界内进行对决。刚刚坐照镜的陈长生于境界而言，与通幽镜的苟寒食相差太多，只是他并未急着认输，反而在一场教宗洒下的雨水之中，领悟出大道的真谛，明修栈道暗渡陈仓反制苟寒食，取得最终胜利。
陈长生的表现令得教宗非常满意，所以哪怕明知他命不久矣，教宗依旧没有放弃他，更是亲自求见圣后，请她为陈长生加冠并授于他国教学院院长一职。想当年，商行舟代表的陈姓一族，对于圣后称帝可谓是诸多阻挠，如今任命陈长生为院长，圣后亦是经过一翻考虑，方才慎重答应教宗的提议。
